На нетронутую природу горной Башкирии обратил внимание в 1771 году путешественник Иван Лепёхин. А в 19-20 веке богатая природа края оказалась в опасности из-за засухи, пожаров и лесозаготовок. Для её сохранения 11 июня 1930 года был образован Башкирский заповедник.

С 1951 по 1958 годы заповедник не функционировал, на его территории работал Южно-Узянский лесхоз. Неконтролируемая охота и браконьерство привели к падению численности охотничье-промысловой фауны этих мест. Была потеряна большая часть зоологических коллекций и гербария, утрачены рукописи с первыми ботаническими описаниями.

В 1958 году усилиями учёных и природоохранной общественности Башкирии заповедник был восстановлен.

«Башкирский заповедник – один из старейших заповедников нашей страны. За годы существования он претерпел изменения, но неизменной осталась цель, которой он служит, – сохранение и изучение уникальных объектов горно-лесной флоры и фауны Южного Урала. Сегодня сотрудники заповедника продолжают традиции бережного отношения к уникальной природе, заложенные ещё в 30-е годы прошлого века», – отметил министр природных ресурсов и экологии России Александр Козлов.

Площадь Башкирского заповедника составляет 49 674 гектара, 80% занимают леса.

На заповедной территории обитает 259 видов позвоночных животных и 1732 вида пауков и насекомых, из которых 12 видов относятся к редким. Здесь сконцентрирована локальная популяция марала, реакклиматизированного в Башкирском заповеднике в 1940 году и расселившегося по региону.

Гнездятся многие хищные птицы, в числе которых занесенные в Красную книгу России филин, беркут и орёл-могильник.

Флора заповедника насчитывает 317 видов лишайников, 121 вид мхов, 810 видов сосудистых растений, 105 из которых являются редкими.

Увидеть уникальную природу можно своими глазами: для знакомства с заповедной территорией разработано несколько маршрутов. Например, на историко-экологической тропе «Башхырт» можно полюбоваться горными вершинами с обзорной вышки и увидеть геолого-культурный памятник «Башхардский шарьяж», а экологическая тропа «Арадый» проходит через все типичные экосистемы края.

«95 лет – знаменательная дата, свидетельство многолетней и кропотливой работы по сохранению уникальных природных комплексов Башкортостана, его флоры и фауны. Благодаря самоотверженному труду, научным исследованиям и просветительской деятельности сохраняется биоразнообразие и поддерживается экологический баланс. Уверен, что и в дальнейшем Башкирский заповедник будет оставаться флагманом природоохранной деятельности, внося весомый вклад в сохранение природного наследия для будущих поколений», – прокомментировал директор Башкирского заповедника Айнур Биембетов.